细菌是一种单细胞微生物，在广义上，各类原核细胞型微生物都属于细菌的范畴。
依据外形，细菌主要可分为球菌、杆菌及螺形菌。其中，球菌可分为葡萄球菌、双球菌、链球菌、四联球菌及八叠球菌等；杆菌可分为链杆菌、棒状杆菌、球杆菌、分枝杆菌等；螺形菌可分为弧菌、螺菌、螺杆菌、弯曲菌等。
作为原核细胞型微生物，细菌具有典型的原核细胞结构，即细胞壁、细胞膜、细胞质及核质等。
细胞壁位于细菌细胞的最外层，一般包绕在细胞膜的周围，依据革兰氏染色法，可将细菌分为革兰氏阳性菌及革兰氏阴性菌。肽聚糖，又称黏肽，是革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌的共有组分，也是细菌细胞壁的主要组分。革兰氏阳性菌的细胞壁相对较厚，除了黏肽外，多存在大量的磷壁酸；革兰氏阴性菌的细胞壁相对较薄，除了黏肽外，多存在外膜。对于细菌而言，细胞壁可保护细菌并维持菌体形态，具有物质交换的作用。此外，细菌细胞壁还与细菌的致病性、耐药性、静电性等相关。
细胞膜，又称胞质膜，位于细胞壁的内侧，紧包细胞质。细菌细胞膜是细菌赖以生存的重要结构，具有物质转运、呼吸、分泌、生物合成、参与细菌分裂等多项作用。
细胞质一般由水、蛋白质、脂类、核酸、糖、无机盐等组成。在细胞质内，多种重要结构如核糖体、质粒、胞质颗粒、核质等蕴含其中。
在上述基本机构的基础上，部分细菌还有着自身的特殊结构，如荚膜、鞭毛、菌毛、芽孢等。